Для проведения спецопераций на базе МР 5 создан специальный вариант MP 5SD, имеющий несъёмный интегрированный глушитель. Этот вариант предусматривает применение стандартных патронов калибра 9 мм со сверхзвуковой пулей, поэтому в стволе выполнено 30 небольших отверстий, через которые часть пороховых газов отводится в заднюю расширительную камеру глушителя. При этом скорость пули снижается до дозвуковой. Пистолет-пулемёт MP 5SD может выпускаться как в варианте MP 5SD2 (с неподвижным прикладом) так и варианте MP 5SD3 (с раздвижным прикладом).

Пистолет-пулемет «Heckler und Koch» MP 5 SD4 представляет собой модификацию MP 5, оснащенную глушителем. Отличие от базовой модели в том, что в стволе просверлено 30 отверстий. Глушитель установлен на стволе и состоит из двух камер. Одна из них напрямую соединена с отверстиями и служит расширительной камерой, уменьшая давление газов и снижая их скорость. Вторая камера заворачивает поток газов при их выходе из дульного среза канала ствола и глушит звук выстрела. Пуля выходит из ствола с дозвуковой скоростью, не создавая звуковую ударную волну в полете.

Создано шесть вариантов этой модели: SD1 с неподвижной пяткой ствольной коробки и без приклада; SD2 снабжен фиксированным прикладом, а SD3 – выдвигающимся плечевым упором, аналогично образцам MP5A2 и A3 соответственно; SD4 отличается от SD1 наличием приспособления контроля автоматической стрельбы на фиксированные очереди по 3 выстрела; SD5 аналогичен SD2, а SD6 – SD3, но имеют такое же приспособление. Следует отметить, что три последние модели оснащены пистолетной рукояткой слегка измененной формы. На ПП могут устанавливаться обычные открытые механические прицельные приспособления, телескопические прицелы, прицелы с усилением изображения цели и прицелы с облучением точки наводки типа АРР (Aiming-Point-Projector – прожектор облучения точки прицеливания) фирмы Хенсольдт.